Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Abcf3Q8K268 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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