Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sde2Q8K1J5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms