Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
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Cldn34c1Q8K193 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn34c1Q8K193 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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