Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZP2

Syn3, Synapsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syn3Q8JZP2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Syn3Q8JZP2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms