Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Card11Q8CIS0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms