Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ercc8Q8CFD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ercc8Q8CFD5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ercc8Q8CFD5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms