Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms