Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc28aQ8CEI3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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