Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam228aQ8CDW1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms