Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lrif1Q8CDD9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrif1Q8CDD9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrif1Q8CDD9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrif1Q8CDD9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lrif1Q8CDD9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms