Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms