Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms