Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CCC3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CCC3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CCC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CCC3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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