Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Atg4aQ8C9S8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atg4aQ8C9S8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Atg4aQ8C9S8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atg4aQ8C9S8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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