Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc187Q8C5V8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Ccdc187Q8C5V8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc187Q8C5V8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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