Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot2Q8C5L3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms