Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube3dQ8BX13 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ube3dQ8BX13 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ube3dQ8BX13 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ube3dQ8BX13 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ube3dQ8BX13 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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