Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp38Q8BW70 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Usp38Q8BW70 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp38Q8BW70 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Usp38Q8BW70 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms