Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pdcl3Q8BVF2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms