Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp43Q8BUM9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp43Q8BUM9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp43Q8BUM9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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