Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ppfia2Q8BSS9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms