Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rd3Q8BRE0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rd3Q8BRE0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rd3Q8BRE0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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