Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpc2Q8BKV1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpc2Q8BKV1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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