Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp1Q8BJQ2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp1Q8BJQ2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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