Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcal1Q8BJL0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcal1Q8BJL0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms