Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrtm2Q8BGA3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms