Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Jmjd4Q8BFT6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms