Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
H2-M10.4Q85ZW8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms