Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ChfrQ810L3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms