Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cldn34b3Q80ZS5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn34b3Q80ZS5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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