Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Lrsam1Q80ZI6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lrsam1Q80ZI6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrsam1Q80ZI6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms