Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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