Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Chn2Q80XD1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms