Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc1Q80VQ1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms