Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cfap100Q80VN0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cfap100Q80VN0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms