Protein–RNA interactions for Protein: Q80VA5

Sh3tc2, SH3 domain and tetratricopeptide repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc2Q80VA5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3tc2Q80VA5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms