Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp8Q80U87 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp8Q80U87 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp8Q80U87 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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