Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
ClmQ7TSN2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
ClmQ7TSN2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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