Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stk40Q7TNL3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stk40Q7TNL3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stk40Q7TNL3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stk40Q7TNL3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Stk40Q7TNL3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms