Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1cQ76I25 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms