Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms