Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Syne2Q6ZWQ0 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms