Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Topbp1Q6ZQF0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms