Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf653Q6YND2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms