Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssx9Q6XAS3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms