Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pcp4l1Q6W8Q3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pcp4l1Q6W8Q3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Pcp4l1Q6W8Q3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pcp4l1Q6W8Q3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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