Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd300aQ6SJQ0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd300aQ6SJQ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms