Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CtifQ6PEE2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CtifQ6PEE2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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