Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prrt3Q6PE13 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prrt3Q6PE13 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms