Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
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Zbtb40Q6PCS8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Zbtb40Q6PCS8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zbtb40Q6PCS8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Zbtb40Q6PCS8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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